Najvišji organ SBC – Kluba slovenskih podjetnikov je skupščina, ki jo sestavljajo prav vsi člani SBC (klub ima 400 članov, podatek za junij 2023). Skupščina voli tako predsednika kluba kot člane 13-članskega upravnega odbora (UO). Skupščina kluba je marca 2023 izvolila prvi sestavi nadzornega odbora (NO) in senata kluba, ki imata vsak po 5 članov. 

Predsednik kluba je Joc Pečečnik, ki je bil izvoljen na skupščini julija 2021 za mandat treh let. Pred tem sta klubu predsedovala dr. Jure Knez (junij 2020-junij 2021), ki ostaja član UO tudi v mandatu 2021-2025, in Marjan Batagelj, ki je klub vodil od ustanovitve januarja 2014 do junija 2020.